水稻打苞随后就是抽穗扬花了，因此也是水稻进行病虫害综合防治的最佳时期，尤其对稻曲病和穗颈瘟要进行预防的关键时期。
稻曲病和穗颈瘟都是水稻穗期影响产量和品质的主要病虫害，稻曲病能使谷粒发黑，并有毒素，影响销售和食用，而穗颈瘟严重时导致稻穗发白，籽粒空瘪而减产，尤其水稻破口抽穗扬花期间雨露雾天气较多时很容易发生，尤其老病区山区发生最重，而且一般优质杂交水稻，或氮肥偏多密度过大田块会加重发生，而穗颈瘟稻曲病防治的关键就是水稻打苞末期，即水稻抽穗前5-7天进行喷药预防，否则等后期田间发生防治就晚了，而且效果也不好。所以对于稻曲病或穗颈瘟一般不管抽穗扬花时有没有阴雨天气，一般都要在水稻打苞末期，即破口抽穗前5-7天进行喷药预防稻曲病穗颈瘟等穗期病害，药剂宜亩用拿敌稳15-20克，或30-40毫升意莎雷、阿米妙收等药，不仅有效防治稻曲病和穗颈瘟，而且还能兼治纹枯病为害，尤其阿米妙收还有调节叶片光合作用，使水稻成熟时杆青籽黄，品质更好作用。如果抽穗扬花期有三到五天以上连阴雨天气的，或感病品种一般在水稻破口抽穗时宜在喷施一次。
水稻打苞期间除病害适期预防外，如果发现田间有稻纵卷叶螟，稻飞虱，即钻心虫等发生危害的，一般还宜亩用15-20毫升19%.氯虫.三氟苯、23%溴虫.三氟苯药剂喷施防治，对上述害虫均有很好效果，当然也可以将上述杀菌剂和杀虫剂混用喷施，达到一喷多防效果。
总之，水稻打苞末期宜重点预防稻曲病或穗颈瘟病害，同时注意兼治其他病虫害，喷药时要避开高温，加大用水量，加足药量对准水稻植株均匀喷施防治。
